
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
实验报告单
学习工作员探索渐渐保鲜冷库日子间隔延后鸡肉的硬性标准、持水特性、质感度、硫化钙含锌量铁含锌量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4程度来估评腿部肌肉策划 组织的铁身故心态。效果展现,保鲜冷库日子间隔延后后,鸡肉的硬性标准在第8天和第6天正相关回落;持水特性消减;红颜色变深,逐渐耗尽质感,鲜朱灰色转成暗朱灰色。除此之外,硫化钙含锌量铁、吸附性氧和MDA的含锌量正相关增长,组织凋亡率正相关提高。 实验的人员领取异同保鲜冷库时间间隔的力量原辅料的球高血清质含量,并且对其进行SDS-PAGE讲解,球高血清质含量条带在异同年间地域分布均匀分布且形似(图1a)。按照球高血清在异同原辅料中的表答原因,讲解发现同个组原辅料的中数字比较接近于于同个关卡(图1b),说力量原辅料球高血清质含量具备不错的组内形似性和组间异同性。 蛋清质组学共评定会出1996种蛋清质。以B0为较组,挑选B1、B2、B4和B6中的蛋清使用差别的传达研究概述,共评定会到3715个DEPs。将火山图多维概述,并可根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个规范标准研究概述DEP。結果如同1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别评定会出22、33、73和140个DEPs,当中别上涨6、11、32和815个,上涨16、22、41和52。聚类分析方式评价指标了有不一致性 冷冻冷藏步骤健身腿部肌肉集体中蛋清质的传达,結果凸显健身腿部肌肉蛋清传达差别的伴随着处理时间段的延长而延长(图1g)。
图1| 各种冷库时长的全身肌肉原辅料血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同保鲜冷库时段的肌肉组织样品管理差别蛋白质讲解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡血清肽的PRM一定量定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG丰度之间的关系描述血清的铁生亡新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT降钙素原检测淀粉酶质组学水平产品保障,拜谱海洋生物已研发项目管理完整并制定了加强比较成熟的转录组学、淀粉酶组学、基础代谢组学甚至多个学联合技術厂品水平产品保障风险管理体系,欢迎致电咨询!
决定性专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.