
近日,合肥医科高中一是附带宠物医院王学浩博士团队协作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法正能量分泌检测分析服务。
日语题头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版名称:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
用户企业:南京医科大学
科研建筑材料:细胞
拜谱给予服务管理:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向药物能量场分解组
科技的路线:
探究但是
01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的重要性基因组
本论述提取HCC癌肿样例(n=7)的单团队上皮上皮细胞RNA测序动态动态数据集来阐述,发现了糖酵解催化活性主耍集中授课在癌肿团队上皮上皮细胞中,hdWGCNA阐述辨别出9个遗传基因控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的我的世界生存游戏下载阐述确实YBX1为自立我的世界生存游戏下载危险 影响因素(图1H)。进一大步结合起来IHC、WB实验设计和癌肿团队与最靠近非癌肿团队的个人空间转录组学动态动态数据集确认YBX1是肝团队上皮上皮细胞癌缓解的未知靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判断为调高HCC生殖细胞糖酵解的关键点基本要素
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点能力基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1切合并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1运用并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化资料其磷碱化,最终得以可以淡化其核转位
进两步加测YBX1的O-GlcNAc糖基化可否作用其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC生殖人体细胞中或用OGT促使剂OSMI-1清理,YBX1淀粉酶的横向取得较低,YBX1磷硝化作用取得增多(图4A-C)。IP进行实验凸显,在同等的Flag-YBX1底物的横向下,YBX1-WT的磷硝化作用的横向取得低过YBX1-T57A,表面磷硝化作用的增大不禁仅是正因为更强的YBX1淀粉酶表明(图4D)。转移了核和质酚类化合物会察觉到TMG清理的HCC生殖人体细胞中YBX1核表明的增高(图4E-F),进两步会察觉到YBX1磷硝化作用的的关键调低因素是AKT(图4G-I)。这一些会察觉到更加注重O-GlcNAc糖基化用使得其磷硝化作用来提升YBX1淀粉酶安全性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达优势于其进步骤进行磷硝化作用表达并要能驱动其核转位
05、YBX1促使PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1带动PKM2转录
06、YBX1 就可以加强组蛋清乳过酸装饰水平面
的研究发现YBX1敲低相关性较低淀粉酶质乳碱化,十分是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的调查灵魂的存在了糖酵解与组淀粉酶乳碱化的随便同步,抑止糖酵解可相关性较低H3K18la品质(图6D)。PKM2过表答爱不可逆转转YBX1敲低伴发的H3K18la减少,之外源乳酸进行处理往往升降H3K18la,还牵动YBX1表答爱上浮,报错的存在领域反馈系统(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR灵魂的存在,H3K18la经过生物富集于YBX1加载子随便推进其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),消息队列现P300 上浮是YBX1加强H3K18乳酰化为用的考核机制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳硝化作用呈现总体水平
好文章个人心得体会
在这个科学研究中有关资料了YBX1在HCC中高体现,同时与糖酵解谜切涉及到。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,以此维持核胆固醇并增多其体现。类似这些装饰还催进YBX1在T57处的磷过酸,催进其核易位。因,一项整个过程强化了糖酵解涉及到表观遗传的转录并刺激性乳酸的带来。虽然,YBX1刺激P300的转录,以求推动组核淀粉酶的乳过酸,很大是H3K18la,H3K18乳过酸同向调节管控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环考核机制图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向疗法动能分解组技术服务,拜谱生物学建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、翻译工作后淡化组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
决定性文献资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.