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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 微信网络药理学学阐释草酸钙肾结石防氧化应激性和慢性炎症影响制度化

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件体系里普通的患病产品之一。肾聚集中CaOx氯化钠晶体过呈现饱和状态累积会引起肾小管細胞挫伤和凋亡,因而引起肾结石的建立。短链皮下碳水化合物酸由肠内内好氧池病菌发孝营养膳食玻璃纤维有,不禁在局布肠内深层中起到使用,而在软件体系横向上也起到关键所在使用。其中的,丁酸是最丰富多样的短链皮下碳水化合物酸,具备着免疫力克制和免疫力克制使用,本论述浅议丁酸对CaOx肾结石的使用举例说明因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山门诊泌尿急诊科吴忠教学、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了数据网络临床药理学服務,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 朋友政府部门:华山医疗机构 研究分析另一半:大鼠、HK-2生殖细胞 排列的信息:差表组(Con)、模板组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱带来技术水平:微信网络药剂学学测试

想法具体步骤图

理论研究导致

钻研人关键在于在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠型号,完成人体生理血生化公式和进行疾病学染色剂等钻研措施知道丁酸能能增多CaOx型号大鼠肾CaOx硫化锌的养成和板材损害,减少CaOx型号大鼠的疾病板材损害和硫化有害物质的过快表达出来。虽然,丁酸还可抑制草酸诱发的HK-2内部板材损害、硫化应激状态和内部凋亡。 为洞察具体深入浅析一下丁酸空间结构特征和靶人类人类dna网站,深入具体深入浅析员从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和三维图空间结构特征(图1A)。能够PharmMapper数值文件库和Uniprot数值文件库办理后共筛分出117个丁酸靶人类人类dna供进一大步具体深入浅析。将人类人类dna列表框加入STRING数值文件库,做出PPI网站具体深入浅析。Cytoscape已给出了排列顺序的前20的核心区靶人类人类dna的详细浅析网站图,比如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。他们核心区人类人类dna与网站中的别人类人类dna均表演出务必的一些性,就说明他们人类人类dna应该充分利用着协同工作效应。GO和KEGG具体深入浅析发现了丁酸核心区人类人类dna的一些路线和怪物学功能性(图1C)。核心区人类人类dna一般的与类固醇的性激素初次回话、防腐蚀应激状态反馈初次回话、吸附性酶氧肿瘤细胞对类固醇的性激素刺激角色的反馈并且对含酸性电化学有害物质的反馈相关的英文。与此同时所写,他们核心区人类人类dna一般的陆续参与了防腐蚀应激状态反馈和对吸附性酶氧的怪物反馈整个过程,是肾结石行成体制中至关重点的路线,这发现丁酸应该在肾结石中充分利用重点效应。

图1| 丁酸形式与靶DNA网站介绍(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进而一个脚印探索丁酸对CaOx肾结石真实切靶dna,探索人士借助GEO数据报告分折库对GSE73680中建康比对与CaOx肾结石客户的dna不同采取了探索。比对组与CaOx结石客户的强势性不同体现dna(DEGs)需求条件为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个dna会发生强势变现,在当中3379个(89.4%)dna体现上浮,404个(10.6%)dna体现变动(图2A)。对DEGs采取聚类分析法算法分折,热图彰显了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析法算法特性(图2B)。接着,探索人士完成GeneCards数据报告分折库人力检测了370个机会与CaOx肾结石涉及的dna,排名就前20位的予测dna基本涉及性评价如下图表达2C表达。为了能让寻找到丁酸的治疗CaOx肾结石的关键点靶点,探索人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及dna处理达到没事个Venn图。以后,CYP2C9被肯定为丁酸危害CaOx肾结石的不确定性靶点(图2D)。除此以外,探索人士还采取了丁酸与CYP2C9的大分子联接,CYP2C9的三氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在根据电脑网络药剂学学推测CYP2C9是丁酸后果CaOx肾结石的靶染色体后,理论研究人群还按照生殖体细胞工作声明了CYP2C9可降低了草酸诱导性的HK-2生殖体细胞的ROS平行、宫颈炎症问题和凋亡。

图2| 多半据库合作探讨预测分析CYP2C9是丁酸影响于CaOx肾结石的靶DNA

论述结杲

本科研前提是知道丁酸在休外和机体均能缓和CaOx肾结石3d模型的氧化反应反应应激状态反应和发炎神经问题,接下来经由网站药剂学学建立获取丁酸影响力CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,还有经由体组织细胞试验印证CYP2C9在草酸盐引发的HK-2体组织细胞ROS的技能水平、发炎神经问题和凋亡。以上知道是因为丁酸或许经由缓和CYP2C9来缓和CaOx肾结石的氧化反应反应应激状态反应,改善发炎神经问题。相应方式中拜谱生物学的技能提供数据了网站药剂学学的技能贴心服务质量,除此之外拜谱生物学的技能可提升 稳重健全完善的DNA组学、蛋白酶质组学、排泄组学等几组学品牌及的技能贴心服务质量,欢迎语呼叫管理咨询! 分类学术论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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