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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物学体mRNA中最猛要的转录后装饰,在真核生物学体的方面的问题和生物学具体步骤中起着至关非常重要的的作用。糖尿病的风险看法障碍性一种不不可逆转的中枢控制系统脑神经控制系统退行性慢性病,近些年成长或许切制度无法是确立,但是或缺可行的防治和疗法的方法。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱怪物为其提供m6A甲基化具体分析系统服务管理,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

一篇文章名字大全:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

加盟商组织:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

学习板材:小鼠脑组织

拜谱展示 科技:m6A甲基化(MeRIP-seq)

提要图:

图1| 小结图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

钻研最终结果

1.DCI小鼠海马中m6A表观遗传呈现的变动

设计人数管理应当创立了高脂饮食习惯和认知能力心里障碍(DCI)的小鼠模特。为有点参考组(n = 3)和DCI组(n = 3)比率内的m6A染色体装饰,设计人数管理选用MeRIP-seq实施了转录组比率内的m6A-seq探讨。在DCI组的10664个代码染色体转录物(mRNAs)一共得知参考组的23719个不从叠的m6A峰。想必以下,DCI组症状出23,759个非从叠m6A峰。之中,9341个甲基化染色体在参考组和DCI组比率内从叠(图2)。

图2| 比较组和DCl组m6a绘制表观遗传的维恩图

共判定出127八个差距甲基化的m6A位点(DMMSs),至少60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化平均水平区别正相关优于對照组。分享其占比具体情况看见m6A峰占比在另一RNA中(图3A),并利用其占比的转录地区划分成低于五组:5'UTR、3'UTR、转录起至位点地区场面、结束用户名和口令子场面、起至用户名和口令子场面和商品编号队列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和结束用户名和口令子附进正相关聚集(图3B)。为了让开展以上什么是DNA上m6A掩盖的地区,实验工作员筛分了有峰引用的地区,并检测法了以上什么是DNA上reads的包裹率。在DCI组中,m6A掩盖区摇摆不定于3'UTR区(图3C)。其它mRNA内的DMMS都被定位功能到染料体上不去开展其占比简况。区别小鼠染料体的m6A掩盖谱区别。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的优化

为考验m6A绘制在DCI小鼠中的生物学技术学职能,学习工作员从2组填入择内含DMMS的蛋白质商品代码人类染色体去GO和KEGG剖析(图4A)。在GO剖析中,高甲基化人类染色体在上皮血上皮内部的时候、生物学技术的时候自我调节、崔化亲水性和杂环氧化物融入中更为明显聚集。KEGG信息环路剖析界面显示信息,高甲基化人类染色体与T上皮血上皮内部多巴胺肾上腺素受体信息信息环路、小上皮血上皮内部1.肺癌和RIG-I样多巴胺肾上腺素受体信息信息环路相关联性(图4B)。而对于低甲基化人类染色体,GO剖析界面显示信息在上皮血上皮内部的时候、代谢转化的时候和融入的时候中更为明显聚集有机的环氧化物、融入杂环氧化物和崔化亲水性(图4C)。KEGG信息环路剖析反映了低甲基化人类染色体与肥厚性心肌病和Hippo信息信息环路的关联性(图4D)。

图4| 之间的关系甲基化m6A位点的通道生物富集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq统计数据的联动剖析

马上又论述相关人员将m6A MeRIP-Seq的参数和之前RNA-Seq的参数采取携手讲解,会发现163个mRNA,m6A峰和mRNA总体质量正相关改变了。41种mRNA的m6A和mRNA总体质量调整,14种mRNA总体质量调整。还有,30个什么是表观遗传mRNA体现调整,m6A总体质量调整,74个什么是表观遗传mRNA体现调整,m6A总体质量调整(图5A)。还有,创建好几个个PPI网络信息来表现163个什么是表观遗传商品编号的蛋清互相的链接(图5B)。

就像文中6图示,GO和KEGG研究研究有四组:(1) m6A调整,mRNA降低;(2) m6A调整,mRNA调整;(3) m6A降低,mRNA降低;(4) 遗传人类dna遗传组遗传m6A降低和mRNA调整。在GO研究研究中,m6A调整和mRNA降低的遗传人类dna遗传组遗传在細胞分解具体步骤、馨香族类化合物菌物镶嵌具体步骤和RNA分解具体步骤的国家宏观调节作用中可观聚集。KEGG研究研究展现,他们遗传人类dna遗传组遗传在肌肉酸分解、小細胞非小内部肺癌、丙酸分解和二甲苯酸分解中聚集。相对 m6A调整和mRNA调整的遗传人类dna遗传组遗传,GO研究研究展现在亚铁配合、亚胺丙氨酸脱羧酶可溶性、天冬氨酸1-脱羧酶可溶性和細胞接触组装流水线负国家宏观调节作用中聚集;KEGG研究研究展现在2型血糖高、肌肉細胞系数信息环路和胰岛素信息环路中聚集。在GO研究研究中,m6A降低和mRNA降低的遗传人类dna遗传组遗传在寡肽配合、谷胱甘肽配合和二硫硫化反应物硫化反应回归酶可溶性中聚集,而在KEGG研究研究中,想一想在百香果酸无限不断循环(TCA无限不断循环)、丙酸分解和多外来物种凋亡中聚集。在GO研究研究中,m6A降低和mRNA调整的遗传人类dna遗传组遗传在胚胎骨膝盖行态再次发生、蛋清激酶可溶性缴活和NADP分解具体步骤中聚集,在KEGG研究研究中,m6A降低和mRNA调整遗传人类dna遗传组遗传在新霉素、卡那霉素和神经末梢莒养系数信息环路中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA表达方法的联动进行分析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG定性分析

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本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物技术提供了m6A甲基化技术性服务质量,拜谱微生物可提供完善成熟的核蛋白组学、新陈代谢组学、转录组学包括两组学综合设备技术设备安全服务,欢迎致电咨询!

考虑资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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