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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

时不时有所作为化工类主要原料而被列举的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废弃物”是“秘宝小氧分子”的辛酸史发展历程一样,直至近四十多年才被察觉其为重要的生物制品学工作,从此之后“侧睡农奴把声乐”,特殊是在免疫力慢性传染性传染病性传染病症状研发业务领域内异彩纷呈。已经在的几篇文报道怎么写了在繁多慢性传染性传染病性传染病症状的猎物整治中带给衣康酸或其药剂学装饰具象化物制品的冶疗益处,并察觉其隐性靶点。观于衣康酸的“这辈子来世”与“这辈子”,详情软文《乳酸的奋斗史好兄弟——衣康酸!这篇陪我清楚衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化体现淀粉酶组学产品,实现1000+玄妙度修饰语位点查出,平衡重新典型靶点,全东南方向生信分享解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现”到“查证”全方法产品,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、科学实验的流程

02、测量资料

03、经“点”重新

在评测信息中,验出2个参考文献中报道怎么写的经曲靶点十分衣康酸遮盖位点,如首先个被得知的衣康酸共价遮盖球淀粉酶KEAP1,还在糖酵解信号通路中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或是炎性小体组合而成球淀粉酶NLRP3和细胞系萎缩的时候中的要素球淀粉酶RIPK3等,其质谱图详细图图示。

04、物料特性

1.多个质控

业务化活性朋友探头孵育、SDS-PAGE测量、WB核实、样例一些性具体分析等各个位测量,保障投资项目结果显示安全可靠性性。

2.高耐磨性质谱检测设备软件

在Orbitrap Astral全新新一批高鉴别质谱仪提升下,做到衣康硝化作用装饰位点及蛋清评定新厚度,力助学科医学研究新看到。

3.全方法一坐式服务的

根据拜谱生物工程改进的工作app,可出具“血细胞培养出→测试探针孵育→WB监测→什么难以理解的度衣康碱化装饰监测→专属于生信分析一下→特定的位点PRM验证通过”全流程步骤售后服务,省时省时省力更贴心。

05、概述信息(一部分)

06、应该用方向上

PART 2、文献资料分享视频

医学文献一

用英语版头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

汉语名称:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研发东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

资料二

英语题目:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文版题目:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探讨东西:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例子具象化理念

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括弱于的底物构建特性,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康过酸修饰语组测试资料资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用呈现(有以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

做为TCA无限循环中的期间细胞分解物,衣康酸调试细胞分解、抗体系统系统和感染期间的互相用,为开展抗体系统系统感染性传染型疾患给予了了替代品开展措施。衣康酸构成中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸构成能对核胆固醇上的活力半胱氨酸残基进行烷基化体现(迈克尔增加不良反应),一种全文翻译后体现被成为“衣康酸体现(itaconation)”,而使危害核胆固醇的功能,国家宏观调控抗体系统系统回话和细胞分解方式,为多种不同传染型疾患肿瘤药物技术创新给予了新思绪。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应装饰球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究或然参考值靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或能量转换消化吸收转化靶向治疗消化吸收转化组产品的对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

分类论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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