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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗原鱼类特异形、寡核苷酸体现利润昂扬或操作工艺流程工艺流程缜密。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲解团队合作在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低料工费、跨鱼类、全机构兼容的全新解决方案。

刊物简洁

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中现代地理学校基因基因基因与发育状况微动物工程调查所和中现代基因基因基因自学主办人的展览学术界界杂志学术论文期刊杂志,迫切需要于媒体报道人的一生地理学和临床基因基因基因学业务范畴行业的媚足性调查研究计划。JGG 2023年度不良影响指数公式7.1,Scopus学术界界杂志学术论文期刊杂志评判指标值CiteScore 9.9,榜排JCR 2023年度GENETICS & HEREDITY业务范畴行业Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY业务范畴行业Q1区,榜排中现代地理学校杂志学术论文期刊杂志区别微动物工程类项1区(Top杂志学术论文期刊杂志),基因基因基因学和生化模式与分子结构微动物工程小类双1区。

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一些 是HEATag

完美的“二合二为一”设计的

HEATag是由凝集素和HUH内切酶产生的相结合核蛋白

「标记器」模块图片 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化表达(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接器」控制模块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)检索方形码进行共价链接。

“1+1>2”的的效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样版标记符号与溯源系统。

Fig1: HEATag多厚标示原因示图图

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实践检验员

HEATag到达 有多用打?

还可以在不一必要条件下,确保喂母乳软体动物上皮细胞核系单上皮细胞核混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研团队合作为 HEATag 設置了多轮 “压差测试英文”,从上皮细胞膜系到上皮细胞膜核,从常溫到常温,从新鲜范本量到固定好范本量,全多方面认可它的固相关性和正规性。

第三轮各种测试面向哺乳期宠物神经受损生殖细胞系:研发考生首选了出自人、鼠、仓鼠3个种群的四大神经受损生殖细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在恒温下能 HEATag 标上后混测序。从而回收利用的 11447 个神经受损生殖细胞中,85.66% 都能依据 HEATag 条型码最准确相配到原种群,样板间交叉点环保问题极低,UMAP 聚类算法探讨无论是就直接证明文件,HEATag 条型码与种群特情人染色体组共同点非常不符。 又,测量因素进这一步升到:论述人群体验在 4℃下标识剥好癌生殖上皮受损受损细胞、在环境温度下标识甲醇不变癌生殖上皮受损受损细胞,还会直接的标识癌生殖上皮受损受损细胞。毕竟但但依然鲜亮:几乎所有因素下,样表产品标签与鱼类问题均具特好的相关,转换精准的率超 95%。纵使甲醇不变会影响轻的转录本重叠污染问题,癌生殖上皮受损受损细胞分离纯化有一少部分 RNA 浪费,癌生殖上皮受损受损细胞类别的标注毕竟但但依然与剥好样表维持完全一致,证明格式 HEATag 还可以标识有差异 整理因素下的研究样表。

Fig2: HEATag 可在区别必要条件下做好单神经细胞转录组混样阐述

会标示母乳喂养哺乳宠物和海洋环境无脊椎骨哺乳宠物的原代肿瘤细胞

若是 说内部系测式是 “基本知识题”,那组织结构样例还是 “增添题”, 以上样例或许因内部业务类型复杂性、工作环境融入性层次性,被选为标示技術的 “常见问题”,而 HEATag 恰恰恰在以上 “常见问题” 上展现什么了优质。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织安排,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞仅仅能被明确辨认,因此关键细胞核内型的聚类分析的结果都比较清楚可辨。

更令人惊喜的是HEATag对深海生态学的自适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长条码与鱼类转录组极具较高一样性,如果没有出来因高盐坏境引发的 “标出生效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可变现喂母乳食草动物组织安排样板多沉 scRNA-seq 了解

Fig4: HEATag可满足优质海洋生物无脊梁骨各种动物诸多 scRNA-seq 数据分析

HEATag与体细胞的整合不懂给予转录组的有效增加

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在顺利完成标识任何的此外,不容易对之后的转录多组分析诱发干忧, 保障了学习数据资料的真人真事性。

Fig5: HEATag并不会直接影响样品的 RNA 表示模式,

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未来的可期

HEATag 能为单神经元研究方案分享那些?

HEATag 的作用,远不止有于 “解决处理图标原因”,它的灵便性和普遍性,正当为单生殖细胞实验打开多概率性

从用3d场景看你

HEATag 能重叠从 “十分简单有点深入分析”(如癌组建与一般组建、药物治疗净化处理与差表)到 “大面积分析”(如组建细胞核膜图谱画出、高通芯片量建立)的全条件业务需求。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等环保型可拓张技术设备的的发展,HEATag 还能进每一步不断提升单细胞核膜分析的通量,力助科研开发团对推进更具面积的项目流程。

从跨区域能力看

HEATag 不但适合用转录组学,还能与表观表观遗传组学、核蛋白组学、发展趋势空间组学等工艺综合,根据订制字段和寡核苷酸回文序列,HEATag 就能够轻轻松松加上与众不同的组学程序,不不良影响4g信号采集长度。同一,因为HEATag还就能够发展趋势单神经元糖组学探究工艺。

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公司合作动态图

拜谱生物技术与陈凯老师实现目标总体战略项目合作性

值不值得的关注的是,在 HEATag 技能展示出非常大APP竞争力的图片背景下,拜谱植物学制品已与华南地区大海科学学习与过程中广东省学习室(东莞)陈凯教援促成初始进行合作意项。买卖双方任务规划围绕着 HEATag 技能的产业链化趴地、科学学习转为等位置绘制厚度操作,力促一种低人工成本、跨种类的单受损神经元核记号技能更加迅速APP于现实情况科学学习3d场景,为比较多学习室给出高效能、城市发展的单受损神经元核学习机器,动力科学学习任务者在受损神经元核植物学制品学、大海植物学制品学、慢性病长效机制等层面拿到比较多上升
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